BD Rhapsody單細胞表達分析儀,免疫(yi)靶向檢測

BD開發(fa)的Rhapsody^TM 單細胞(bao)分析系統與傳統的(de)全轉錄組測序(xu)分析（WTA）相比(bi)，可(ke)以(yi)同時處(chu)理(li)12個樣(yang)本(ben)，極大程(cheng)度(du)節省(sheng)了(le)實驗時間和成本。并且可以區分異質細(xi)(xi)胞，沒有(you)傳統方(fang)法取(qu)單細(xi)(xi)胞混合(he)樣本平均(jun)值(zhi)的劣勢。除了(le)需要上(shang)illumina系統進(jin)行(xing)測序(xu)之外(wai)，全轉錄組分析的細(xi)(xi)胞處理，RNA提(ti)取(qu)純(chun)化和文庫制(zhi)備(bei)等步驟(zou)，Rhapsody^TM 單(dan)細胞分析系(xi)統都能完成。

數千(qian)個單細胞(bao)數百個基因的平行分析

單細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao) RNAseq 正(zheng)在(zai)改變我(wo)們對細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)的(de)(de)理(li)解。BDRhapsody™單細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)分析系統基于 BD 在(zai)細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)生物學領域 40年的(de)(de)專業技術，滿足您的(de)(de)實驗需求(qiu)，在(zai)單細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)水平理(li)解細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)形態和(he)功能。

這(zhe)種全(quan)新的分析系(xi)統(tong)克服了傳統(tong)檢測的局限性，例如微陣(zhen)列和大量(liang)細(xi)(xi)胞(bao) RNAseq，這(zhe)些(xie)檢測通(tong)過實現(xian)對各個(ge)細(xi)(xi)胞(bao)之間的微妙差異(yi)的觀察，依賴于對多個(ge)細(xi)(xi)胞(bao)的平均檢測。用戶可以鑒定和表征新型和罕見細(xi)(xi)胞(bao)類型，其進(jin)一(yi)步幫助理(li)解(jie)從免疫學(xue)(xue)到腫瘤學(xue)(xue)等多個(ge)領域內的生物(wu)學(xue)(xue)過程(cheng)。

BD Rhapsody單(dan)細胞分析系統能夠(gou)對成千上萬個單(dan)細胞的(de)數百個表達基(ji)因進(jin)行數字定(ding)量，提供(gong)足(zu)夠(gou)靈活的(de)定(ding)制測定(ding)法以滿足(zu)任何實驗需要，其有效(xiao)系統可縮短實(shi)驗時(shi)間(jian)和降(jiang)低測序成本。

產(chan)品特點(dian)

捕獲(huo)并分離(li)細胞，通過(guo)磁(ci)珠對細胞和mRNA轉錄本(ben)進(jin)行分類

The BD Rhapsody cartridge enables single-cell capture and indexing of cells and mRNA transcripts on magnetic beads.

分子(zi)標簽可以克服PCR偏(pian)差

Patented technology assigns unique cell and molecular indices to generate more accurate transcript quantification.

可以定制靶向組合（panel）

Characterize novel and rare cell types using custom or predesigned targeted gene panels.

提供數據分析(xi)工具

The BD Rhapsody system provides all the tools needed to analyze, visualize and understand your data.

BD Rhapsody系統主要(yao)應用(yong)的靶(ba)向基因檢測試(shi)劑(ji)盒（panel）

靶向方(fang)法有助于提高單(dan)細胞測序效率，并推動對(dui)當(dang)今一(yi)些挑戰性(xing)的科學領域的進一(yi)步探(tan)索。BD經驗證的(de)檢測試劑盒（panel）顯示穩定且可重現的(de)細(xi)胞(bao)異(yi)質性陣列，可用于探索(suo)與眾多應用相關的(de)細(xi)胞(bao)類型。BD Rhapsody 系(xi)統包括(kuo)以下檢測試劑盒（panel）：

□ BD Rhapsody Onco-BC 靶向檢測試(shi)劑盒（panel） – 與(yu)乳(ru)腺癌和免(mian)疫細胞(bao)相關的 400 個基因

□ BD Rhapsody 免(mian)(mian)疫反應檢測(ce)試(shi)劑盒（panel） – 免(mian)(mian)疫細胞類型(xing)譜分(fen)析

□ BD Rhapsody  T-細胞靶向(xiang)檢(jian)測試劑盒(he)（panel）

□ BD Rhapsody 補充檢測試劑盒（panel）

□ BD Rhapsody 自定義檢(jian)測試劑盒（panel）

更(geng)(geng)有(you)效的測序可以(yi)更(geng)(geng)低的成本(ben)實(shi)現(xian)更(geng)(geng)高的通(tong)量

由于(yu)與(yu)高通量實驗(yan)方法相關(guan)的測(ce)序(xu)成本，單細胞(bao)實驗(yan)往(wang)(wang)往(wang)(wang)非(fei)常昂貴。BD Rhapsody 單細胞(bao)分析系統設計有多個功能，可(ke)以(yi)更有效地(di)利用測(ce)序(xu)來降低(di)實驗(yan)成本。

靶(ba)向(xiang)測(ce)定(ding) - 由于檢測(ce)靈敏度(du)的(de)提高(gao)，特定(ding)的(de)基因組(zu)合方法可使用少量(liang)的(de)時(shi)間(jian)和(he)成(cheng)本(ben)，幫助產生(sheng)類似于全(quan)轉錄組(zu)分析(xi)（Whole Transcriptome Analysis，WTA）測(ce)定(ding)的(de)結果。這種(zhong)方法還提高(gao)了 UMI 計數效率，從而(er)極大(da)程度(du)的(de)節省(sheng)了實驗時(shi)間(jian)和(he)成(cheng)本(ben)。

儲(chu)存(cun) - 從樣本中得到的(de)完整 cDNA 可在(zai)磁珠上(shang)穩(wen)定(ding)存儲(chu)，允許將珍貴樣本(ben)保存長達 16 周。這可使(shi)用戶在時間允許的(de)情況下靈(ling)活地對樣本(ben)進行測(ce)序，并通過(guo)對儲(chu)存的(de)磁珠(zhu)池進行等分(fen)或分(fen)樣來(lai)實現同(tong)一樣本(ben)的多個測定。

分(fen)樣(yang) - 在磁(ci)珠上儲存的(de) cDNA可以分成一(yi)個或(huo)多個等(deng)分試(shi)樣(yang)，并使(shi)用(yong)定制或(huo)預先設計的(de)組(zu)合（panel）進行擴增。通過提供對(dui)部(bu)分樣(yang)本進行測序的(de)選項(xiang)和對(dui)樣(yang)本不同(tong)組(zu)合（panel）進行測試(shi)的(de)靈活性，分樣(yang)可降低成本。

干細胞-：

系統組件

□ BD Rhapsody 掃描(miao)儀

□ BD Rhapsody 上樣臺

□ BD Rhapsody 卡式芯片(pian)

□ 分子標簽(qian)試(shi)劑和(he)文庫(ku)制備

□ 特定(ding)應用的靶(ba)向檢測試(shi)劑盒（panel）

□ 生物(wu)信(xin)息學工具

BD Rhapsody系統工作流(liu)程：單(dan)細胞端到(dao)端分析

1. 單細(xi)胞分離并捕獲(huo)mRNA。

2. cDNA合成，UMI標記(ji)轉錄本。

3. cDNA擴增(zeng)，制備(bei)文庫

4. Illumina測序(xu)儀(yi)測序(xu)

5. 數據分析。

單(dan)細胞分離和mRNA標記(ji)流程

1.在(zai)微孔中(zhong)，一(yi)個細胞與一(yi)個條碼標記磁珠匹配

2.裂(lie)解細胞將 mRNA與磁(ci)珠上條(tiao)碼標記的捕獲寡(gua)核苷酸(suan)雜交

3.磁(ci)珠(zhu)回收

4.cDNA 合成

5.測序(xu)和構建(jian)單細胞基因表達譜

組(zu)件

掃描(miao)儀和上樣臺

掃描儀掃描每個cartridge，它的微(wei)孔(kong)內含細(xi)胞和(he)磁珠。包(bao)括活細(xi)胞或死細(xi)胞，微(wei)孔(kong)含單細(xi)胞或成對細(xi)胞。

上樣(yang)臺：簡(jian)單、實惠(hui)、便攜；適合(he)放(fang)置組織培養物。

單細胞單基因(yin)索引

同時標記細胞和mRNA

當(dang)對序列讀取進行計數時(shi)，PCR 擴(kuo)增偏(pian)差可(ke)導(dao)致基因定量不(bu)準確(que)。BD 的(de)(de)分子(zi)(zi)標簽（UMI）技術為(wei)單個細胞的(de)(de)單個基因分配了*的(de)(de)分子(zi)(zi)索引，也稱為(wei)“分子(zi)(zi)條形碼(ma)"。實驗者可(ke)借此克(ke)服擴(kuo)增偏(pian)差，更準確(que)地計算轉錄(lu)水(shui)平。

從左到(dao)右依次為

磁珠

Univ：Universal Illumina adapter sequence。通用illumina接頭序列。

CL：Cell specific sequence細胞特異序列。同磁(ci)珠上的寡(gua)核苷酸相同。大約有(you)88.5萬種細胞標(biao)記。

UMI：Unique molecular index。每個(ge)mRNA分子有相同標簽。UMIs種類(lei)：約(yue)6.6萬。數字定量mRNAs，并且克服(fu)PCR擴增偏(pian)差。

Poly-dT：mRNA尾(wei)連(lian)接。

數據自(zi)動(dong)分(fen)析(xi)

Complete analysis pipeline 分析通道

Provide visualization tool 可視化工具(ju)

Minimal bioinformatics  knowledge required 信息學知識要求低

Output data compatible with variety of secondary analysis tools輸出數據與多種二級(ji)分析工具兼容

Data processing transparency 數(shu)據處理過(guo)程透明

Local and cloud based 本地和云端數(shu)據(ju)

installation options 可選安裝

靈活選擇(ze)Panel

已有(you)panel：~400 targets selected and wet lab validated

乳癌 人(ren)T細胞表達 免疫反應panels（人(ren)和鼠）

補充panel：按需增加100個(ge)額外(wai)targets

Customize pre-designed or  custom base panels with  additional targets

Enhance coverage or correct  issues easily and cost  effectively

Expand panels and explore  unexpected targets iteratively,  based on experimental results

定制基礎panel ：~100 – 500 targets per panel  selected by users or with help  from BDG

Easy to use web tool for  target selection and primer  design for in silico verification Human and Mouse

BD Rhapsody 免(mian)疫反應檢測試劑盒（panel） – 免(mian)疫細胞類型譜(pu)分(fen)析

BD Rhapsody™ Immune Response Targeted Panel (Human)

Targeted human immune gene panel for the BD Rhapsody Single-Cell Analysis System

•經過(guo)驗證的靶向檢測panel，專注于(yu)與人類免疫細胞表型相關(guan)的基因

•與3'全轉錄組測序(xu)方法相比，靶向測序(xu)方法需要的reads少(shao)很多

•可重(zhong)復(fu)的分析(xi)方法適合多種應用

人體(ti)(ti)免疫系(xi)統是一種復雜的(de)器官和細胞類型(xing)的(de)防(fang)御網(wang)絡，能夠抵抗(kang)病原體(ti)(ti)，環境(jing)抗(kang)原和癌癥。 免疫應答包括(kuo)多種細(xi)胞相互間的復雜作用。 這些細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)參與外來病原體或細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)的監視和(he)(he)識別，炎癥信號的分泌和(he)(he)募集，特定(ding)的適應(ying)性(xing)免疫細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)的協調和(he)(he)擴增(zeng)以及用于免疫記憶(yi)和(he)(he)抗體產生的適應(ying)性(xing)細(xi)(xi)胞(bao)(bao)(bao)的成(cheng)熟。了解這些過程如(ru)何正(zheng)常發揮功(gong)能(neng)和(he)(he)調節異常是理解諸如(ru)炎癥，感染和(he)(he)癌(ai)癥等疾病的基(ji)礎。

• Validated panel focuses on genes relevant to phenotyping human immune cells

• Targeted sequencing approach requires dramatically fewer reads than a 3’ whole transcriptome sequencing approach

• Reproducible assay empowers numerous applications

The human immune system is an intricate defense network of organs and cell types that protect against pathogens,environmental antigens and cancer. The immune response consists of complex interactions among several cell types. These cells are involved in surveillance and recognition of foreign pathogens or cells, secretion and recruitment of inflammatory signals, coordination and expansion of specific adaptive immune cells, and maturation of adaptive cells for immune memory and antibody production. Understanding how these processes function normally and in instances of dysregulation are fundamental to understanding such diseases as inflammation, infection and cancer.